Μάθημα: Υπολογιστικές μέθοδοι μακρομοριακών συστημάτων
- Το πρόβλημα των μεγάλων χρόνων χαλάρωσης στα μακρομοριακά συστήματα
- Σύντομη επανάληψη της θεωρίας των στατιστικών συνόλων με έμφαση στα μακρομοριακά συστήματα
- Η μέθοδος της μοριακής δυναμικής (MD)
- Η μέθοδος της μοριακής δυναμικής εκτός ισορροπίας (NEMD)
- Η μέθοδος Monte Carlo (MC): Έξυπνες κινήσεις για μακρομοριακά συστήματα
- Θεωρία μεταβατικών καταστάσεων για την ανάλυση σπάνιων φαινομένων στα μακρομοριακά συστήματα (εφαρμογή στη διάχυση μικρών μορίων μέσα από πολυμερικά γυαλιά)
- Αδροποιημένες μέθοδοι προσομοίωσης μακρομοριακών συστημάτων
- Η μέθοδος dissipative particle dynamics (DPD)
- Η μέθοδος της δυναμικής κατά Brown (BD) για μακρομοριακά συστήματα
- Μοντέλα δικτύου (π.χ., τύπου slip-link) για μακρομοριακά συστήματα
Course: Computational methods for macromolecular systems
- The problem of multiple time and length scales in macromolecular systems
- A quick introduction to Statistical Ensembles with emphasis to macromolecular systems
- The method of Molecular Dynamics (MD)
- The non-equilibrium molecular dynamics (NEMD) method
- The Monte Carlo (MC) method: Novel sampling schemes for macromolecular systems
- Transition State Theory (TST) for the analysis of infrequent events in macromolecular systems
- Coarse-grained methods for macromolecular systems
- The dissipative particle dynamics (DPD) method
- The method of Brownian Dynamics (BD) for macromolecular systems
- Slip-link and other network models for macromolecular systems